Сергей Юрьевич Аваков родился в 1958 г. в Тбилиси. В 1980 г. окончил ТРТИ, в 1981-1996 гг. работал в институте, обучался в очной аспирантуре.
В середине 90-х гг. при поддержке Администрации Таганрога стоял у истоков создания нового вуза - Таганрогского института управления и экономики, призванного решать важную для города проблему подготовки кадров в области юриспруденции, экономики и управления. С 1996 г. Аваков – бессменный ректор вуза.
За 25 лет из стен ТИУиЭ вышло более 6500 дипломированных специалистов, на базе вуза было защищено 55 кандидатских и 20 докторских диссертаций. Немало работников банковской и налоговой системы, экономических и маркетинговых служб предприятий, органов местного самоуправления, силовых структур и других организаций Таганрога, Ростовской области, России и зарубежья являются выпускниками ТИУиЭ. Преподаватели и студенты ТИУиЭ многократно становились победителями и лауреатами международных и российских конкурсов.
С.Ю. Аваков проводит большую международную работу, выступая инициатором сотрудничества ТИУиЭ с рядом зарубежных вузов, организации международных конференций, осуществления образовательного обмена делегациями студентов и преподавателей. Дипломы вуза признаны мировым сообществом, что позволяет выпускникам института продолжать образование в университетах Европы и США без дополнительных условий.
Благодаря созданию и развитию ТИУиЭ проведены реставрация и ремонт шести исторических зданий в центре Таганрога, находившихся в аварийном состоянии. Сегодня в этих восстановленных зданиях расположены учебные корпуса института.
Сергей Юрьевич Аваков - доктор экономических наук, профессор, член-корреспондент РАЕН, член Союза ректоров России, Заслуженный работник высшей школы РФ. Награжден нагрудным знаком «Почетный работник высшего и профессионального образования РФ», медалью «300 лет российскому флоту».
Звание «Почетный гражданин города Таганрога» присвоено Сергею Юрьевичу Авакову в 2019 году.